水族箱里诞生了4条小鱼其中包括哈罗德的女儿伊莎贝尔伊莎贝尔的身上长着不好看的斑点还缺失了一些鳞片她的长相遭到鱼群的其他成员嘲笑鱼群首领瑟斯顿要求哈罗德必须把伊莎贝尔藏起来否则被人来发现将会把他们丢进大海里贪玩的伊莎贝尔还是被人类发现了她和哈罗德一起被丢进浩瀚无边的大海里海上突如其来的巨大风浪使得水族箱里的鱼都掉进大海一时之间伊莎贝尔和哈罗德失散了伊莎贝尔偶遇了艾普尔并结识了一群长相奇特的鱼它们皆因外在缺陷被同族排挤在艾普尔的带领下伊莎贝尔和其它鱼准备穿越火山抵达珊瑚礁寻找哈罗德另一边哈罗德在海黄瓜卡尔的陪同下找寻女儿未果伤心欲绝随鱼群离去成功穿越火山的伊莎贝尔在珊瑚礁与哈罗德相遇而珊瑚礁女王的出现更令父女惊喜原来女王竟是伊莎贝尔的妈妈一家人欢聚在一起