故事以15年前的北大西洋上一件海难作序幕这宗海难是由一艘在深夜浓雾中航行的货轮引起的由于未能及时发现航道上有巨大冰山货轮猛烈撞上冰山后导致引擎室受到重创整艘船也在不久后彻底沉没虽然大多数船员顺利获救但船长与一名船员还是不幸罹难而在15年后的东京大都会大财团的著名设计师在驾车时突然心脏病发作连人带车冲向山谷车子在坠落山谷后起火燃烧设计师当场气绝身亡这两宗分别发生于两个不同年代的意外居然是一场惊天大阴谋的序幕幕后黑手选择了豪华邮轮爱芙罗黛蒂号作为展开阴谋的地点恰巧江户川柯南毛利兰毛利小五郎等人参加了这艘邮轮的首次航行仪式他们将一步步揭开幕后黑手的阴谋让真相水落石出
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